Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms