Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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