Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms