Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNA2P20248 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms