Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR1P18146 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR1P18146 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms