Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GNB3P16520 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB3P16520 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB3P16520 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms