Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms