Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMC1P11047 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms