Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD1P0DJD0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms