Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBP07199 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBP07199 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms