Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGF1P05230 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FGF1P05230 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGF1P05230 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGF1P05230 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms