Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms