Protein–RNA interactions for Protein: P01766

IGHV3-13, Immunoglobulin heavy variable 3-13, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-13P01766 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-13P01766 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms