Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3BO95985 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3BO95985 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3BO95985 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms