Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYF2O95926 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYF2O95926 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms