Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms