Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms