Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms