Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIN3BO75182 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms