Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms