Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms