Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXO3O43524 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms