Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1BO15143 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms