Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASKO14936 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASKO14936 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms