Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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