Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F3O00716 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F3O00716 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms