Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DFFAO00273 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DFFAO00273 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DFFAO00273 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DFFAO00273 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DFFAO00273 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms