Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN34H7C241 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN34H7C241 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN34H7C241 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms