Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms