Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms