Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms