Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP27XA6NNY8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP27XA6NNY8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP27XA6NNY8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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