Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSDA5PKW4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms