Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms