Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB19A4D1S5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms