Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms