Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4BQ9Y4P1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms