Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCML1Q9UN30 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms