Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms