Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18L2Q9UHA2 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms