Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCF2Q9UG63 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms