Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms