Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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