Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EHD3Q9NZN3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms