Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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