Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms