Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms