Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP7BPQ9NSQ0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms