Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms