Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEBOXQ9HB31 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms